Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms