Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A8-203ENST00000430500 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PDZK1-201ENST00000344770 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 UGT1A10-201ENST00000344644 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KY-205ENST00000508956 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 M6PR-201ENST00000000412 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LOXL2-201ENST00000389131 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CPSF3-202ENST00000460593 3157 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FAM98A-202ENST00000403368 2818 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CHKB-CPT1B-202ENST00000453634 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 UTP14A-201ENST00000394422 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MMP2-202ENST00000437642 2469 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RPEL1-201ENST00000441178 2130 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HIPK1-203ENST00000369553 2883 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PIP4K2C-203ENST00000540759 2876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EPM2A-217ENST00000639423 2886 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FAM124B-203ENST00000409685 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINA10-204ENST00000554723 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CHST4-202ENST00000539698 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CWC22-202ENST00000410053 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL645504.1-201ENST00000429443 1809 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 STRADA-247ENST00000640679 1816 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 IL17REL-202ENST00000389983 3668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHGA9-202ENST00000616887 2568 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SATB2-AS1-205ENST00000450728 3314 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL3-204ENST00000409069 2614 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PAX6-243ENST00000638903 2620 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK1G-201ENST00000009105 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LRG1-201ENST00000306390 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1324-203ENST00000369939 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms