Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PTPRJQ12913 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PTPRJQ12913 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PTPRJQ12913 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PTPRJQ12913 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PTPRJQ12913 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPRJQ12913 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PTPRJQ12913 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PTPRJQ12913 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PTPRJQ12913 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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