Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP4P49662 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP4P49662 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP4P49662 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP4P49662 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP4P49662 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP4P49662 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASP4P49662 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CASP4P49662 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CASP4P49662 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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