Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms