Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPM2P07951 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPM2P07951 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPM2P07951 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPM2P07951 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms