Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT1

ERBIN, Erbin, humanhuman

Predictions only

Length 1,412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBINQ96RT1 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 CREB5-203ENST00000396299 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AC104423.1-201ENST00000591742 728 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 PDZRN3-AS1-202ENST00000608304 774 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 DNASE1L3-207ENST00000486455 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AC083873.1-201ENST00000421179 1099 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AL365194.1-201ENST00000440032 361 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERBINQ96RT1 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms