Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCG3Q8WXD2 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms