Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms