Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms