Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms