Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL034417.4-201ENST00000641354 2101 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms