Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ADGRE2-212ENST00000601345 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 OXA1L-213ENST00000612549 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms