Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC018511.1-201ENST00000436608 380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 DDTP1-201ENST00000443589 383 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 RN7SL229P-201ENST00000495651 299 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC109830.1-203ENST00000506638 467 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC010280.2-201ENST00000507733 410 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC142391.1-201ENST00000515823 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 MIR7-3HG-204ENST00000588758 865 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 162 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 TCTE1-201ENST00000371504 616 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 RN7SL225P-201ENST00000464648 298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC020893.2-201ENST00000506083 723 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC121757.1-201ENST00000552441 624 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 LINC00868-203ENST00000592919 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 AC007728.3-201ENST00000602304 746 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 C17orf98-201ENST00000614158 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTF1AQ7RTS3 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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