Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 HFE-204ENST00000349999 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 MYL2-201ENST00000228841 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PCDH10Q9P2E7 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PCDH10Q9P2E7 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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PCDH10Q9P2E7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PCDH10Q9P2E7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PCDH10Q9P2E7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PCDH10Q9P2E7 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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PCDH10Q9P2E7 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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PCDH10Q9P2E7 AP000926.2-201ENST00000469983 358 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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PCDH10Q9P2E7 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 HEXB-205ENST00000509579 806 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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PCDH10Q9P2E7 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 ZNF528-AS1-204ENST00000601562 1069 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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