Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 PDE9A-211ENST00000398232 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 NME1-201ENST00000013034 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 LINC00969-204ENST00000420851 868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 AL590068.2-201ENST00000426067 378 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 FANCD2OS-204ENST00000450660 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 RN7SL186P-201ENST00000466485 297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 RN7SL743P-201ENST00000475032 298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 RN7SL386P-201ENST00000485776 297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 RAB11A-203ENST00000564910 978 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 TRAPPC2L-214ENST00000568583 801 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 PMEL-215ENST00000550464 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 SERTAD3-202ENST00000392028 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 GPM6B-203ENST00000356942 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 CLNS1A-201ENST00000263309 1172 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 SARNP-201ENST00000336133 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 AC111200.1-201ENST00000358778 657 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 AL365366.1-201ENST00000414898 853 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 AKR1B1P4-201ENST00000426552 922 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 C12orf71-201ENST00000429849 957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 CHCHD4P4-201ENST00000437690 327 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 AC116049.1-201ENST00000505282 385 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 MEF2C-AS1-205ENST00000509179 388 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 AC090772.2-201ENST00000578443 564 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 MIR6511B1-201ENST00000612014 85 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 AC010271.2-201ENST00000614440 588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NESP48681 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NESP48681 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NESP48681 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NESP48681 AC004951.1-201ENST00000447643 1866 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NESP48681 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NESP48681 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NESP48681 TMLHE-201ENST00000334398 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NESP48681 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NESP48681 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NESP48681 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NESP48681 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 HIST1H1E-201ENST00000304218 754 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 GAGE10-201ENST00000407599 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 PPIL3-204ENST00000409361 897 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 Metazoa_SRP.186-201ENST00000617234 362 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NESP48681 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 LY6D-201ENST00000301263 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 RN7SKP170-201ENST00000362550 328 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 CST13P-203ENST00000413633 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 AC083873.1-201ENST00000421179 1099 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 AC109779.1-202ENST00000439810 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 PHBP5-201ENST00000449310 768 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 GAPDHP1-201ENST00000452570 1005 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 AC068298.1-201ENST00000465165 161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 AC068620.1-201ENST00000470544 798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 RN7SL304P-201ENST00000488028 301 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 FAXDC2-205ENST00000517938 1203 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 OR6F1-203ENST00000641444 1698 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms