Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms