Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 LILRA4-201ENST00000291759 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC091564.7-201ENST00000545572 464 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ZNF548-207ENST00000597400 589 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 C8orf86-202ENST00000437935 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TPD52L3-203ENST00000381428 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PPM1N-204ENST00000401593 548 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AL391152.1-202ENST00000551408 624 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 LINC00470-211ENST00000584492 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 KATNAL2-202ENST00000356157 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MTND6P14-201ENST00000433044 522 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 HOPX-209ENST00000508121 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC018755.1-201ENST00000601315 1182 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC007378.1-201ENST00000609765 478 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 NICN1-208ENST00000615713 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC106872.1-201ENST00000512492 1360 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PABPC1-219ENST00000522387 2331 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PGAP2-235ENST00000532523 1696 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 LINC01044-201ENST00000413637 657 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CNN2P9-201ENST00000417134 909 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC015909.2-201ENST00000523083 547 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SNRPCP5-201ENST00000531775 189 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ERH-202ENST00000555373 586 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CTBP2P7-201ENST00000593270 1244 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 KIR2DP1-201ENST00000415311 1331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC073316.2-201ENST00000414126 418 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PPP3CB-AS1-201ENST00000422977 930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RPSAP19-201ENST00000431241 880 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC006111.1-201ENST00000573982 329 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AL589843.2-202ENST00000602289 740 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SPATA22-203ENST00000397168 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PRSS2-205ENST00000632998 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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