Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 S100B-202ENST00000367071 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC006372.1-201ENST00000449903 546 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC090095.1-201ENST00000519275 871 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AP003717.2-201ENST00000534962 898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC138907.9-201ENST00000623747 986 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AP000925.1-201ENST00000425960 1449 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SLC29A3-201ENST00000373189 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 RTP2-201ENST00000358241 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CCRL2-202ENST00000399036 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CHMP2A-201ENST00000312547 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 KRTAP12-4-201ENST00000391618 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AL592463.1-201ENST00000451108 635 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SKAP1-AS1-201ENST00000582246 687 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CTBP2P7-201ENST00000593270 1244 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CHMP2A-206ENST00000600118 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 FP671120.4-201ENST00000629969 923 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC106799.1-201ENST00000503188 1676 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AL445933.2-201ENST00000440249 265 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 COQ5-202ENST00000445328 992 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC003072.1-201ENST00000510957 612 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 IGHVII-65-1-201ENST00000519992 302 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC019254.1-202ENST00000558515 645 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC090236.1-201ENST00000590318 768 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 ZNF544-209ENST00000596929 543 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC127526.5-201ENST00000637148 1110 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CACNG1-201ENST00000226021 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CDA-201ENST00000375071 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 IQCF5-201ENST00000446461 512 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC113340.1-201ENST00000475257 636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 OR10V2P-201ENST00000525296 764 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC022239.3-201ENST00000528629 544 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 KRT18P7-201ENST00000557241 1219 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC092301.1-201ENST00000601618 764 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AL355353.1-201ENST00000604014 330 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 DLG2-AS1_2.1-201ENST00000614607 218 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 GALNTL6-207ENST00000616459 1254 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms