Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 POTEC-201ENST00000358970 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 GIMAP4-202ENST00000461940 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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