Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRJQ12913 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.7 ms