Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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