Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCAPH2Q6IBW4 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms