Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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