Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRXP46100 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 HUS1-202ENST00000432325 1125 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC022483.2-201ENST00000461464 555 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 MYADML-202ENST00000490394 797 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC023886.1-202ENST00000504009 477 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC087441.1-201ENST00000531069 301 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 DHRS1-202ENST00000396813 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC092431.1-201ENST00000415342 420 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 RPL10P13-201ENST00000550757 303 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC090772.2-201ENST00000578443 564 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 RN7SL405P-201ENST00000582502 289 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AC020728.1-201ENST00000605749 1216 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRXP46100 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRXP46100 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRXP46100 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRXP46100 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AQP7P1-201ENST00000412626 1045 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC011890.1-201ENST00000427955 303 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC004803.1-202ENST00000545629 569 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 RHOJ-202ENST00000555125 548 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MXRA7-205ENST00000588114 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MIR6776-201ENST00000616678 59 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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