Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ZNF479Q96JC4 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms