Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 AC103876.1-203ENST00000565495 290 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 AC068987.3-201ENST00000637934 1195 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 LINC02381-202ENST00000635070 1341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIRT1Q96EB6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms