Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 OR13A1-203ENST00000553795 2078 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 CPT1B-204ENST00000405237 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 TMC2-201ENST00000358864 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 BANK1-201ENST00000322953 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 PTCD2-211ENST00000536805 1911 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 EME1-201ENST00000338165 2339 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 MTMR2-202ENST00000352297 3350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 PDK2-216ENST00000614357 2493 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 TTLL13P-206ENST00000641754 2256 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 CNBD2-204ENST00000489667 2531 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 UCP3-201ENST00000314032 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AC005537.1-203ENST00000629291 1748 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MYRIPQ8NFW9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms