Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SMTNP53814 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SMTNP53814 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SMTNP53814 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SMTNP53814 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SMTNP53814 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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