Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LINC02348-201ENST00000618724 489 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 SETDB1-202ENST00000368962 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 GGNBP1-201ENST00000374458 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 AC026461.4-201ENST00000379816 242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 MEOX1-203ENST00000393661 1206 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 RRM2P2-201ENST00000436212 652 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 IFT22-204ENST00000437644 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 AL158824.1-201ENST00000451825 450 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 MIR3177-201ENST00000578255 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 MIR3689A-201ENST00000578854 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 AC104440.1-201ENST00000605010 343 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 AL390728.4-202ENST00000606173 430 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 ETV7-208ENST00000627426 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NESP48681 CFAP58-201ENST00000369703 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 HLA-DQA1-203ENST00000395363 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 PQLC1P1-201ENST00000434950 429 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 XIAP-AS1-201ENST00000458331 482 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 RBPMS-205ENST00000517860 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 AC008738.4-201ENST00000590492 700 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 RNF141-202ENST00000528665 1374 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 PLA2G1B-201ENST00000308366 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 CD72-203ENST00000378431 849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 CIDECP-203ENST00000424691 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 UQCRFS1P2-201ENST00000426701 722 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 HTR3D-203ENST00000428798 1215 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 VDAC1P13-201ENST00000447826 859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 HTR3D-204ENST00000453435 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 RN7SL342P-201ENST00000479616 294 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 RN7SL771P-201ENST00000482328 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 SNCA-208ENST00000505199 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 SNRPCP5-201ENST00000531775 189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 HNRNPA1P62-201ENST00000559372 952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NESP48681 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 RPL36P20-201ENST00000423702 319 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 E2F6P4-201ENST00000468625 514 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 AC113340.1-201ENST00000475257 636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 PHBP8-201ENST00000493810 725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 DHDDS-216ENST00000525682 1235 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 GLTP-205ENST00000544393 914 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 AC013489.2-201ENST00000558732 276 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 ZNF548-209ENST00000598895 571 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 AC244230.1-201ENST00000623463 498 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 FAM25BP-203ENST00000624613 404 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 TNNT3-217ENST00000641225 877 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NESP48681 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms