Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 GIMAP4-202ENST00000461940 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TROAP-202ENST00000380327 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 IGKV2D-26-201ENST00000390268 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CDY6P-201ENST00000413320 1266 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TAC3-205ENST00000415231 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 WISP1-204ENST00000517423 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SAP30L-AS1-202ENST00000519727 396 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 LINC00929-202ENST00000556159 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC093802.2-201ENST00000567853 583 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 FGF11-205ENST00000575398 990 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MIR3194-201ENST00000582236 73 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AP000892.2-201ENST00000613535 324 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC010271.2-201ENST00000614440 588 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC121247.1-201ENST00000622888 1232 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AL590552.1-201ENST00000623164 1770 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PDE9A-211ENST00000398232 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PTPRMP28827 AC019185.2-201ENST00000424628 520 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PTPRMP28827 HNRNPA1P24-201ENST00000476029 1046 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 IGHVII-65-1-201ENST00000519992 302 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC109446.3-201ENST00000567344 641 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MIR3689A-201ENST00000578854 78 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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PTPRMP28827 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PSMC1P1-201ENST00000478110 1320 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 IL1RAP-210ENST00000434491 1565 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PHKA1P1-201ENST00000420457 621 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AL355493.1-201ENST00000422707 808 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 NDUFC2-KCTD14-201ENST00000528251 566 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AL133297.2-201ENST00000563162 485 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AL390728.4-202ENST00000606173 430 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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