Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1P21675 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC025257.1-201ENST00000550926 375 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SNAP25-202ENST00000304886 2050 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms