Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z7

HCFC2, Host cell factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC2Q9Y5Z7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC2Q9Y5Z7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC2Q9Y5Z7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC2Q9Y5Z7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC2Q9Y5Z7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC2Q9Y5Z7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms