Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUBP2Q9Y5Y2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUBP2Q9Y5Y2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms