Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms