Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAI2Q9Y5P3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms