Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF6Q9Y4K3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms