Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATF5Q9Y2D1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATF5Q9Y2D1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF5Q9Y2D1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms