Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y215

COLQ, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLQQ9Y215 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLQQ9Y215 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLQQ9Y215 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms