Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-11Q9UQG0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-11Q9UQG0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms