Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms