Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN8AQ9UQD0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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