Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHANK2Q9UPX8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.3 ms