Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB2Q9UPW6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB2Q9UPW6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms