Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms