Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNP9

PPIE, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIEQ9UNP9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PPIEQ9UNP9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPIEQ9UNP9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPIEQ9UNP9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPIEQ9UNP9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms