Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNPO2Q9UMS6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SYNPO2Q9UMS6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNPO2Q9UMS6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms