Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF1Q9UMS5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF1Q9UMS5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF1Q9UMS5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms