Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF112Q9ULX5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms