Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP2Q9ULQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRIP2Q9ULQ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRIP2Q9ULQ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms